Остров Комодо, кръстен на известния гущер, живеещ на него, е най-големият остров от Националния парк Комодо с 390 km2. Разположен в западната част на парка, Комодо е по-малко посещаван от остров Ринка поради местоположението си, което го прави малко по-див. Приблизителната популация на гущери, обитаващи острова, е 1000 индивида, което я прави малко по-ниска в сравнение с тези на Ринка. На острова има диви прасета, водни биволи, елени Сумба, маймуни, диви коне и много видове змии. Комодо се състои от три различни вида растителност със савана по цялата брегова линия, покриваща 70% от острова, мусонна гора със суха тропическа гора, разположена между морското равнище и надморска височина от 500 метра, и гора, започваща от 500 метра надморска височина. Връх Саталибо е най-високата точка на Комодо, достигащ 730 метра.
